👏🏻👏🏻

I am so honoured to receive this prestigious distinction from #ISCB. 🥰

Thank you so much 🙏

Cool to see Sophie Schbath in this year's promotion

Et pendant ce temps là elle faisait ses slides en html. La diversité c'est la beauté du monde !

Et la compile please.

I certainly hope to not receive any review requests for this type of software. DOI is fine, but I don't want to see informatics journals start accepting '"I" rewrote program X in language Y' type articles.

Give a toy to a cool kid, he'll break it but he'll think of ways to fix it too. Check Igor's blog post on ntHash.

GitHub - broadinstitute/poasta: Fast and exact gap-affine partial order alignment Fast and exact gap-affine partial order alignment. Contribute to broadinstitute/poasta development by creating an account on GitHub.

github.com/broadinstitu... ?

Anyone recommend any rust implementations of consensus generation via partial order alignment?

@guigau.bsky.social

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A table showing the base statistics for four datasets: ATB/no dustbin, no unknown; ATB/Dustbin; ATB/Salmonella Enterica; and ATB/Escherichia Coli. For each dataset, the table provides the size in GB, the number of references, and the number of kmers. The ATB/no dustbin, no unknown dataset is the largest at 130.51 GB with over 1.8 million references, while the ATB/Dustbin dataset has the highest kmer count at over 55 billion.

[Construction] With an experimental pipeline building directly to m-Fulgor, we indexed 98% of the AllTheBacteria v0.2 dataset (all species excluding unknown and dustbin) in 4 days. The resulting index takes just 130GB, for 1.8M genomes.
Figure: basic stats for some indexes. (4/6)

Amazing work, as always, from @ale-campa.bsky.social! Now you can index AllTheBacteria v2 (sans dustbin and unknown) in only 130G. It’s always a pleasure to work with @jermp.bsky.social and @ale-campa.bsky.social, and I’m very excited for where Fulgor is going next!

Two more days to submit your abstract for a short talk or poster at RECOMB-Seq 2026. See instructions at recomb-seq.github.io/seq2026/call...

C'est un triste constat que ce soit encore vers Google qu'on se tourne mais c'est Scholar mon outil de travail.

Effectivement la concommitence de la fin de l'abo wos m'a fait faire la même prédiction

« Il sert à tout sauf à financer la recherche » : la charge du prix Nobel Philippe Aghion contre les milliards gaspillés du CIR Lors d’une table ronde au « Printemps de l’Economie », le prix Nobel Philippe Aghion a dénoncé l’inefficacité du dispositif très généreux français, capté par les grands groupes et qui le défendent en ...

L'absence de politique industrielle depuis le tournant du siècle, et les milliards déversés au privé chaque année sans contrôle, en pure perte pour le bien commun, est devenue si évidente que même l'inspirateur de ces politiques de recherche a du le reconnaitre.
www.challenges.fr/economie/il-...

On aimerait. Je voudrais le montant pour commencer (je veux bien ouvrir les paris).

Connaissez-vous les conditions d'achat de Mistral par les organismes de recherche ?

Sébastien Chenu sur X : "Je suis ravi de voir Jordan Bardella amoureux et que tous les deux soient épanouis ! N'en déplaise à certains, tout le monde n'a pas vocation à finir comme une prof de sociologie à Nanterre, moche, mal coiffée et aigrie !"

RT si tu aimes les profs de sociologie à Nanterre, moches, mal coiffées et aigries.

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Il faut prendre le temps de goûter tout le sel contenu dans cette déclaration : si Sarkozy continue à se dédouaner sur le dos de Guéant, celui-ci le balance. Si l’ancien président de la République se fait doux comme un agneau, tout le monde comprendra qu’il se sait coupable… Perdant-perdant.

Il s'agit donc de poursuivre la politique de destruction des conditions de travail des enseignants et d'étude des élèves.

Il était au contraire possible de saisir l'opportunité démographique pour faire tout le contraire, en améliorant la qualité pour toutes et tous.
Ce risque est écarté.

It looks terribly cool

Is April 13 the new April 12? #keydate

France is switching from Microsoft to Linux

"We must become less reliant on American tools and regain control of our digital destiny. We can no longer accept that our data, our infrastructure, our strategic decisions depend on solutions whose rules, pricing, evolution, and risks we do not control."

The great news from Hungary isn't so much that Orbán was defeated (yes, that is good news, but I'm not persuaded his replacement will be so much better): the really encouraging thing is that it was possible to defeat Orbán despite all his efforts to cement his grip on power.

J'appréciais sa recherche, pensée à ses proches.

Bonjour à tous.tes
Nous avons l'indicible douleur de vous faire part du décès de Séverine Erhel, survenu ce lundi 13 avril 2026 à Rennes.
(information diffusée à la demande / avec l'autorisation de la famille)

Accepted to ISMB'26. Revised paper is here: jermp.github.io/assets/pdf/p.... I'd like to thank @robp.bsky.social once again and all the received feedback from the reviewers. To me, ISMB has had the highest quality review process over the past few years!