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Posts by Angelo Varlotta

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Calcolatrice elettronica portatile Canon Palmtronic 8-T.
1976 Giappone, un esempio di design #spaceage

1 month ago 41 2 0 0
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La pandemia non ha insegnato nulla alla politica
O forse le priorità di oggi sono altre
#SalviamoSSN

www.ilsole24ore.com/art/a-sei-an...

1 month ago 79 28 2 0

Bellissima riflessione.
E forse il problema non è neanche troppo degli sportivi, che sanno riconoscere il valore degli avversari in una competizione, ma della società moderna che ha dato alle parole di De Coubertain un altro significato, spostando la competizione fuori dallo sport.

1 month ago 0 0 0 0
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kermit the frog is standing in front of a brick wall and saying evil laugh ALT: kermit the frog is standing in front of a brick wall and saying evil laugh
2 months ago 1 0 0 0
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L'Europa contro la Silicon Valley: una battaglia per la democrazia - Valigia Blu La battaglia non riguarda tanto i regolatori europei e la Silicon Valley, quanto piuttosto quello che sembra essere un profondo disallineamento ideologico.

💈 L’Europa contro la Silicon Valley: una battaglia per la democrazia
www.valigiablu.it/europa-silic...

2 months ago 98 32 5 3

The curious case of people living in the badlands, titolo italiano Ultima fermata Eboli.

2 months ago 1 0 0 0
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Sembra una una supernova in infrared....ma è un cellula e i suoi early and late endosomes in Super Resolution

2 months ago 25 2 3 0
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📄 Marquez-Legorreta et al., Whole-Brain Co-Mapping of Gene Expression and Neuronal Activity at Cellular Resolution in Behaving Zebrafish, bioRxiv, 2026.
DOI: doi.org/10.64898/202... 12/12

2 months ago 2 0 0 0

La domanda che questo lavoro lascia aperta e su cui riflettere: se l'identità molecolare predice in modo così sistematico il functional coupling brain-wide, quanto dei pattern che chiamiamo "network dynamics" sono in realtà il riflesso diretto della biologia molecolare della cellula? 11/12

2 months ago 2 0 1 0

Considerazioni: il pannello genico è limitato a 41 geni (i recettori con bassa RNA expression sono difficili da rilevare), l'accuracy è attorno all'80%, e lo studio non ha ancora attraversato la peer review. Il campione di n=3 animali per gruppo principale è incoraggiante, ma rimane ridotto. 10/12

2 months ago 1 0 1 0

L'effetto si osserva persino durante l'attività spontanea, senza alcuno stimolo esterno, e si intensifica durante la visual stimulation. Gli ensemble definiti geneticamente non sono artefatti indotti dagli stimoli: sembrano possedere una coerenza funzionale... 9/12

2 months ago 1 0 1 0

Il dato più generale, e forse più importante: i neuroni che condividono l'espressione dello stesso gene mostrano activity correlations significativamente più alte rispetto ai neuroni vicini che non lo esprimono. Questo vale per la maggior parte dei 39 geni analizzati, in tutto il cervello. 8/12

2 months ago 1 0 1 0

Un altro esempio: i neuroni pou4f2_cckb nell'optic tectum rispondono in modo selettivo a stimoli di oscuramento e looming visivo. Gene expression, localizzazione spaziale e risposta funzionale coincidono con una precisione che i metodi tradizionali non avrebbero potuto rivelare. 7/12

2 months ago 2 0 1 0

Un esempio: i neuroni pvalb7+/eomesa+ nel dorsal pallium, struttura omologa all'ippocampo dei mammiferi, mostrano calcium activity strutturata in risposta a compiti comportamentali a soli 6 giorni dalla fertilizzazione. Funzionali ben prima che la struttura raggiunga maturità anatomica. 6/12

2 months ago 1 0 1 0
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Il risultato? 332 molecular subtypes, definiti dalla co-expression di combinazioni di geni, e oltre 2.000 subpopolazioni classificate per funzione, genetica e anatomia. Tutte riproducibili tra animali diversi, il che non è affatto scontato per la mole di neuroni analizzati. 5/12

2 months ago 1 0 1 0

I numeri dello studio: circa 77.000 neuroni per cervello con profili completi di activity traces e gene expression per 41 geni simultaneamente. Un throughput 200–300 volte superiore ai metodi precedenti che tentavano di collegare funzione e identità molecolare. 4/12

2 months ago 1 0 1 0

WARP = Whole-brain neuronal Activity and RNA Profiling. Un team del Janelia ha combinato light-sheet calcium imaging (per osservare i neuroni attivi), expansion microscopy e multiplexed in situ hybridization, nello stesso cervello di pesce zebra (zebra fish) 🐟. 3/12

2 months ago 1 0 1 0

Il problema di fondo: sappiamo da tempo che identità molecolare e attività neuronale sono collegate. Ma studiarle insieme, a livello whole-brain, con risoluzione single-cell, in un animale è fattibile e cosa comporta? Fino ad ora, è stato tecnicamente molto complicato. 2/12

2 months ago 1 0 1 0

È possibile vedere un neurone attivarsi assieme ai suoi geni all'interno del cervello? Il preprint discusso nel thread studia proprio il rapporto tra gene expression e funzione neuronale all'interno dell'organizzazione cerebrale, nel pesce zebra 🐟. WARP (2026)🧵 1/12
#scicomm #neuroscienze #scienza 🧪

2 months ago 2 0 1 0

📄 Marquez-Legorreta et al., Whole-Brain Co-Mapping of Gene Expression and Neuronal Activity at Cellular Resolution in Behaving Zebrafish, bioRxiv, 2026.
DOI: doi.org/10.64898/202... 12/12

2 months ago 0 0 0 0

The open question worth sitting with: if molecular identity so reliably predicts functional coupling brain-wide, what does that mean for how we model neural circuits? And how much of what we call "network dynamics" is actually molecular biology in disguise? 11/12

2 months ago 0 0 1 0
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Honest caveats: only 41 genes profiled (receptors with low RNA expression are harder to detect), registration accuracy ~80%, and this is a preprint (peer review pending). Replication in n=3 animals is encouraging but the sample size is modest. 10/12

2 months ago 0 0 1 0

This held even during spontaneous activity (no stimulus), and was further enhanced during visual stimulation. Gene-defined ensembles appear to be intrinsically coherent, not just stimulus-driven artifacts. 9/12

2 months ago 0 0 1 0

The headline result: neurons sharing expression of the same gene show significantly higher activity correlations than nearby neurons that don't, brain-wide, for most of the 39 genes tested. Gene identity constrains functional coupling. 8/12

2 months ago 0 0 1 0

Another: pou4f2_cckb neurons in the optic tectum respond selectively to dimming and looming stimuli. Gene expression + spatial location + function, all aligned. This is what a true functional-genetic-anatomical atlas looks like. 7/12

2 months ago 0 0 1 0

One concrete finding: pvalb7+/eomesa+ neurons in the dorsolateral pallium, a region homologous to the mammalian hippocampus, already show task-structured calcium activity at 6 days post-fertilization. Functional before the structure fully matures. 6/12

2 months ago 0 0 1 0

From this, they identified 332 molecular subtypes, defined by co-expression patterns across 40 genes, and over 2,000 functional-genetic-anatomical subpopulations. Each one reproducible across animals. 5/12

2 months ago 0 0 1 0

The scale is hard to overstate: ~77,000 neurons per brain with both activity traces AND gene expression profiles for 41 genes. That's 200–300x the throughput of previous approaches linking function and molecular identity. 4/12

2 months ago 0 0 1 0

WARP = Whole-brain neuronal Activity and RNA Profiling. A team at Janelia combined light-sheet calcium imaging (watching neurons fire), expansion microscopy, and multiplexed in situ hybridization (reading gene expression) in the same zebrafish 🐟 brain. 3/12

2 months ago 0 0 1 0

The core problem: we've long known that molecular identity and neural activity are linked. But studying them together, brain-wide, at single-cell resolution, in a behaving animal? Until now, technically out of reach. 2/12

2 months ago 0 0 1 0
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