Congrats Sophie !
Well deserved , so proud for you !

A great meeting with a warm welcome from our spanish colleagues !

End-to-end evaluation of pipelines for metagenome-assembled genomes reveals hidden performance gaps www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.04...

Ce que contient le SIAAG

La DINUM annonce le Socle Interministériel d'IA Générative, une offre mutualisée pour déployer l’IA générative dans les administrations françaises.

👉 alliance.numerique.g...

Whenever I presented Phold, I was frequently asked "can you do the same beyond phages?" We ( @oschwengers.bsky.social @linsalrob.bsky.social @binomicalabs.org et al) finally did it with Baktfold github.com/gbouras13/ba... www.biorxiv.org/content/10.6...

🧐 Baisse du nombre d'offres d'emploi (post-doctorants, ingénieurs, permanents ou temporaires) en 2025.

🫵 Besoin de vous pour comprendre les raisons de cette diminution via ce sondage : grist.numerique.gouv.fr/o/docs/forms...

📎 Bilan plus détaillé : www.sfbi.fr/blog/article...

[📢 #Workshop] Vous souhaitez en savoir plus sur la mise en conformité FAIR des données de métabarcoding ?
🗓️ Rendez-vous le 10 avril 2026 de 13h30 à 17h, pour un workshop en visio, organisé par le projet MUDIS4LS (www.ifb-elixir.fr/rd-innovatio...).

La Suite numérique de l’État : critique des critiques Framasoft prend rarement position sur la politique numérique de l’État. La dernière fois où nous l'avions fait, c'était il y a 10 ans, en 2016, dans un article intitulé « Pourquoi Framasoft n'ira plus...

A lire, cet excellente histoire des rapports de l'État avec le logiciel libre et du projet La suite numérique : framablog.org/2026/03/19/l... merci @framasoft.org

✨ GCC2026 | Clermont-Ferrand, France 🇫🇷
The Galaxy Community Conference brings together researchers, developers, trainers, and users to share their work and ideas.
📣 Submit your abstract by April 6.

galaxyproject.org/events/gcc20...

Ten Common Misconceptions About Galaxy (And Why They're Wrong!) We are thrilled to announce that 'Ten Common Misconceptions About Galaxy (And Why They Are Wrong!)' has just been published in PLOS Computational Biology! This paper is the result of passionate discus

Check this out 👀
“Ten Common Misconceptions About Galaxy (And Why They Are Wrong!)” is now published in PLOS Computational Biology!
The paper takes on 10 persistent myths about Galaxy and responds with evidence and real-world examples from the community.

galaxyproject.org/news/2026-02...

A reference-free pipeline for detecting shared transposable elements from pan-genomes to retrace their dynamics in a species - Genome Biology Background The role of transposable elements (TEs) in host adaptation has gained interest in recent years. Individuals of the same species undergo independent TE insertions, providing genetic variabil...

We are pleased to announce the publication of panREPET, a pipeline that identifies TE insertions shared by groups of individuals.
By Saidi, Blaison, del Pilar Rodríguez-Ordóñez, @johannconfais.bsky.social, @hquesneville.bsky.social
📖 doi.org/10.1186/s130...

Graphic celebrating a milestone for the Galaxy Training Network. Large text at the top reads “Congratulations to the Galaxy Training Network on 500+ tutorials!” Below is a screenshot of the Galaxy Training Hall of Fame page showing statistics: 517 contributors, 35 topics, 501 tutorials, and 10.6 years. The “501 tutorials” box is highlighted with a red starburst. A world map with contributor locations appears beneath the statistics.

🎉 Time to celebrate! The Galaxy Training Network just passed 500 tutorials!
Free. Open. Community-built. Reproducible.
Powered by 500+ contributors worldwide, making data analysis accessible to everyone.
Be sure to check out this amazing team and the GTN, here: training.galaxyproject.org

Vous codez en R et souhaitez adopter le package #Tidyverse pour manipuler vos données de façon plus poussée ?
👉 Notre cycle de formation vous propose ce module de 2 jours à Jouy-en-Josas (78)
📅 30-31 mars 2026.
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous avez besoin de vous former à #Linux ?
👉 Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas
📅 1er avril 2026
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Logo MERIT SFBI

📌 Enquête MERIT-SFBI sur les conditions de travail des bioinformaticien·ne·s dans les instituts de recherche, universités, établissements d’enseignement et recherche, secteur associatif ou privé

📎 framaforms.org/enquete-meri...

⏳ temps estimé : 20 minutes
📅 date limite de réponse : 31/03/2026

[LAST CALL] 📢🚨✍️ École thématique d’assemblage et annotation de génomes et métagénomes, organisée par l'
@ifb-elixir-fr.bsky.social @inserm.fr @inrae-france.bsky.social
Pré-inscriptions ouvertes jusqu’au 20 février !

A reference-free pipeline for detecting shared transposable elements from pan-genomes to retrace their dynamics in a species - Genome Biology Background The role of transposable elements (TEs) in host adaptation has gained interest in recent years. Individuals of the same species undergo independent TE insertions, providing genetic variabil...

🚨📢📄 Article in press in Genome Biology doi.org/10.1186/s130...
We introduce panREPET, a reference-free pipeline to detect shared transposable element (TE) insertions across pangenomes and retrace their evolutionary dynamics #TEsky 🧵👇

Toujours le même constat et aucune action : « Le 2 février, 6 040 personnes qui étaient parvenues à joindre le 115 ont été laissées sans solution d’hébergement, soit 10 % de plus qu’à la même date en 2024. Parmi elles, 1 793 étaient des enfants – dont 390 âgés de moins de trois ans »

Logo JOBIM2026 Strasbourg

📌 #JOBIM2026 - Strasbourg (jobim2026.sfbi.fr)

📝 Appel à soumission jusqu’au 15/03. Infos : premc.org/doc/JOBIM202...

🏆 Prix meilleures talk et posters. Participation à la soumission de votre résumé

🚆👶 10 bourses de voyage ; demande du 30/04 au 21/05 + bourses garde d'enfant. Infos : www.sfbi.fr

Vous utilisez déjà Galaxy et souhaitez vous familiariser avec les méthodes et outils d’analyse bioinfo de données NGS ? #mapping #assemblage
👉Notre cycle de formation vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas (26 mars).
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous souhaitez vous initier aux bonnes pratiques pour la reproductibilité de vos analyses ?
👉 Nous vous proposons ce module d’un jour à Jouy-en-Josas (24 mars 2026).
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous pratiquez R et souhaitez créer votre 1e application web interactive à partir de scripts R ? #Shiny
Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module d’1 jour à Jouy-en-Josas (23 mars 2026).
📝 Inscription et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

72 chercheuses inscrites sur la tour Eiffel : «Plus on creusait, plus on trouvait des femmes brillantes aux parcours hallucinants» Marie Curie, Paulette Libermann, Sophie Germain… Les noms d'éminentes scientifiques seront gravés en lettres d'or comme l’ont été ceux de leurs homologues masculins. Un remède à leur invisibilisation, même si la route est encore longue.

Marie Curie, Paulette Libermann, Sophie Germain… Les noms d’éminentes scientifiques seront gravés en lettres d’or, d’ici 2027, sur la tour Eiffel. L'astrophysicienne Isabelle Vauglin : «On travaille à pas de fourmis contre l’invisibilisation des femmes»

Besoin de vous former au langage R ? Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" propose ce module introductif à Jouy-en-Josas sur 2 jours (10 et 11 mars 2026).
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous pratiquez R mais souhaitez faire des graphiques sophistiqués avec le package #ggplot2 ?
Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module d’un jour à Jouy-en-Josas (12 mars 2026).
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Besoin de manipuler vous-même votre jeu de données #RNAseq, depuis les étapes de bioinformatique à l’analyse différentielle, sans passer par la ligne de commande unix ?
Ce module de 3 jours à Jouy (16-18 mars) est pour vous !
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Vous souhaitez apprendre à annoter et comparer vous-même vos génomes bactériens ?
Notre cycle de formation "Bioinformatique par la pratique" vous propose ce module de 2 jours à Jouy-en-Josas (19-20 mars 2026).
📝 Inscriptions et programme sur documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Connexion directe de Galaxy à Recherche Data Gouv

GitHub - ebiggers/libdeflate: Heavily optimized library for DEFLATE/zlib/gzip compression and decompression Heavily optimized library for DEFLATE/zlib/gzip compression and decompression - ebiggers/libdeflate

🗜️⚡ If you use gzip/gunzip a lot in your pipelines, switch to the faster"libdeflate" versions instead! They use modern CPU capabilities to achieve a 2-3x speedup.

libdeflate is in conda, and "libdeflate-gzip" and "libdeflate-gunzip" are drop-in replacements. #unix

github.com/ebiggers/lib...

Notre cycle 2026 de formation "Bioinformatique par la pratique" est ouvert 🎉.
16 modules proposés de mars à juin, ouverts à tous !
👉 Planning et inscriptions : documents.migale.inrae.fr/trainings.html