🚀 Exciting Opportunity to come: Launch of the first ATLASea PhD Call, April 16, 2026.

More information soon: www.atlasea.fr/en/

#call #applications #marine #genomics #EBP #ERGA #CNRS #CEA #MNHN #ANR #PEPR #France2030

Very happy that this is finally accessible 😊

Beyond the amazing 3D models that can be downloaded in several formats, @leaveylab.bsky.social added lesson plans for using them in anatomy teaching.

We also detail the protocol for AI-based segmentation that I developed during my previous postdoc.

Découvrez le squelette et la peau du rhinocéros de Louis XV🦏.
Ils ont été réunis numériquement par
@m0neverest.bsky.social
dans le cadre du projet #e-COL+ !

Take a look at the skeleton and skin of Louis XV's rhinoceros🦏
They have been digitally reunited by @m0neverest.bsky.social in the #e-COL+ project !

a shallow wooden tray has eight smaller white cardboard boxes in it with rows of carefully preserved and pinned small butterflies, either white with dark freckles or yellow with orange wing tips, seen from directly above

Tom and John Emmel and Sterling Mattoon officially began their work on “The Butterflies of California” book in 1974.

Now, more than 50 years after they began, the book draft has officially been published online and is freely available to the public:
www.floridamuseum.ufl.edu/science/the-...
🦋📕

Le rhinocéros de Louis XV entre dans l’ère numérique - e-COL+ Le rhinocéros de Louis XV entre dans l’ère numérique Offert en 1770 au roi Louis XV par le gouverneur de Chandernagor, ce rhinocéros indien mâle est l’un des spécimens les plus emblématiques du Muséum...

Louis XV’s rhinoceros enters the digital age 🦏✨

Thanks to the #e-COL+ project, its skeleton and taxidermy have been digitised in #3D, bringing together two historic @mnhn.fr treasures in a unique digital model!

Full story here (also in English):
➡️ ecolplus.fr/le-rhinocero...

Le rhinocéros de Louis XV entre dans l’ère numérique - e-COL+ Le rhinocéros de Louis XV entre dans l’ère numérique Offert en 1770 au roi Louis XV par le gouverneur de Chandernagor, ce rhinocéros indien mâle est l’un des spécimens les plus emblématiques du Muséum...

Le rhinocéros de Louis XV entre dans l’ère numérique 🦏✨

Grâce au projet #e-COL+, son squelette et sa naturalisation ont été numérisés en #3D, réunissant deux trésors historiques du @mnhn.fr dans un modèle numérique unique

#PatrimoineNumérique

Version détaillée ici :
➡️ ecolplus.fr/le-rhinocero...

Kick-off meeting for the interdisciplinary cluster ‘Heritage, Collections, Patrimony’

Launch of the interdisciplinary hub “Heritage, Collections, Patrimony” at UBE on 24 November 2025

🎓 A day of discussions on physical and digital collections.

J. Thomas and E. Fara presented #Récolnat and #e-COL+, highlighting the importance of standardising #FAIR #data.

Réunion de lancement du Pôle « Héritages, Collections, Patrimoines » (HCP)

Lancement du pôle interdisciplinaire « Héritages, Collections, Patrimoines » de l’UBE le 24 novembre 2025

🎓 Une journée d’échanges sur les collections physiques et numériques.
J. Thomas et E. Fara ont présenté #Récolnat et #e-COL+, soulignant l’importance de normaliser les données #FAIR #data

3D scanning session of Afrotheria at UCBL

The palaeonto & geological collections of LGL-TPE (lgltpe.fr/tous-platefo...) are being modernised to make their treasures more accessible thanks to @e-colplus.bsky.social

V. Genillon (M1 TPE, UCBL/ENS Lyon) is contributing to the digitisation of #Afrotheria, including sirenians and proboscideans.

session de numérisation en 3D des Afrotheria à UCBL

Les collections paléonto & géologiques du LGL-TPE (lgltpe.fr/tous-platefo...) se modernisent pour rendre leurs trésors plus accessibles grace à @e-colplus.bsky.social

Valentin Genillon (M1 TPE, UCBL/ENS Lyon) contribue à la numérisation des #Afrotheria : siréniens et proboscidiens

Enormous whale skeleton suspended in a diving pose in a vast gothic space full of people

10 years ago, the London NHM cleverly manufactured a controversy when they announced they'd be replacing Dippy the Diplodocus in their main hall with a blue whale skeleton.

Long story short, the whale rules, in spite of its notable handicap of not being a dinosaur. 🧵

L'équipe de Consult.O., Thierry Oudoire et Hugo Bordet, a numérisé et reconstruit plus d’une centaine de référents (« types porte-noms ») d’ammonites des #collections de paléontologie-géologie de l’Université Claude Bernard Lyon 1. Merci à Nicolas Rinder pour la formation et l’accompagnement ! 👏 L’intervention a pu être réalisée grâce au soutien du Laboratoire de Biogéosciences - UBE CNRS EPHE de l’Université Bourgogne Europe. Merci à Emmanuel Fara ! 💡 L'intervention s’inscrit dans le cadre du projet e-COL+. Elle illustre la politique de #numérisation3D, de soutien à la #recherche en #paléontologie et de mise en valeur des collections.

Aide à la #numérisation3D pour #e-COL+

L’équipe Consult.O. (T. Oudoire, H. Bordet) a numérisé plus de 100 types d’ammonites des #collections de l’UCBL (tinyurl.com/ystcv6s2), avec le soutien du labo Biogéosciences (UBE CNRS EPHE), merci Emmanuel Fara !

🙏 Merci Nicolas Rinder pour la formation !

Modèle 3D du scan, en tomographie à rayons X, d'un spécimen de poisson-castor. L'encadré blanc met en valeur les restes de son dernier repas

Fiers de voir #eCOL+ cité par @lsu.bsky.social Museum of Natural Science pour son aide sur des poissons du @mnhn.fr 🐟

Dan Sinopoli a analysé 55 spécimens de poisson-castors et orphies. L'un des spécimens scannés par #eCOL+ présentait les restes de son dernier repas!

👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...

3D scan of a bowfin from the MNHN, skeletons of stomach contentes circled in white

Proud to see #eCOL+ mentioned by the @lsu.bsky.social Museum of Natural Science for its assistance with the @mnhn.fr fish study 🐟

Dan Sinopoli analysed 55 specimens of bowfin and garfish. One of the specimens scanned by #eCOL+ showed the remains of its last meal!

👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...

Charlène Guillaumot présente ses travaux sur la pose automatique de landmarks 3D grâce au Deep Learning

"#Biodiversité & #IA" de l’INEE @cnrsecologie.bsky.social a réuni +190 personnes pour explorer les apports de l’IA à la recherche sur la biodiversité.

Le projet #eCOL+ était bien représenté
🎤 R. Vignes-Lebbe – IA & Texte
🎤 N. Navarro – IA & Image
🧠 C. Guillaumot – Deep Learning et landmarks 3D

Defensive fungal symbiosis on insect hindlegs Dinidorid stinkbugs were reported to possess a conspicuous tympanal organ on female hindlegs. In this study, we show that this organ is specialized to retain microbial symbionts rather than to perceiv...

Wow, nature is too cool! Structures on stinkbug hind legs that used to be interpreted as ears are actually chambers with fungi. The bugs coat their eggs in those fungi to protect them against parasitoid wasps. 🧪

Defensive fungal symbiosis on insect hindlegs | Science www.science.org/doi/10.1126/...

Added a few newly collected Ichneumon species to Ichneumonids of North America. Amazingly, I've found 31 different species based on females when records only show 4 for the state! Compare that with 57 species in Main, which is probably a fairly complete inventory.

#entomology #newspecies #taxonomy

Small clay model of a four-legged animal standing sedately. There’s a human figure for scale (Coryphodon shoulders are chest high)

Coryphodon now in head down charging pose. Life sized model in milled foam in a warehouse setting

Finished model painted blue with white cut-out skull and femur. Elbow resting on a bucket

Finished model installed in gallery on yellow platform, surrounded by illuminated illustrations of other animals

A few behind-the-scenes photos of Minimalist Coryphodon. After a couple colleagues expressed disappointment that our “giant” of the Paleocene wasn’t all that giant, I pushed for a more agro pose.

I wanted visitors to leave understanding that an animal this size could easily crush them!

Original drawing from Guillaume-Antoine Olivier of a Megasoma gyas, a huge dark beetle with golden hair and huge horns on torso and head.

I’m (finally) reading about Dynastinae morphological character and I stumbled upon Guillaume-Antoine Olivier, who described many species such as Megasoma gyas... in 1789 and in the following years.
I like to imagine the guy "Yeah France is on fire rn but I’m going to describe my insects tyvm"

e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes. Projet e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes a bénéficié d'une aide de l’État PIA3-ANR-21-ESRE-0053

Our website www.ecolplus.fr has a brand-new look ✨
Discover:

- the #digitization of French natural history #collections
- the equipment available
- our partner institutions
- a dedicated page for the latest news

👉 And it’s now available in English too!

e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes. Projet e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes a bénéficié d'une aide de l’État PIA3-ANR-21-ESRE-0053

Le site www.ecolplus.fr fait peau neuve ✨
Vous y trouverez :

- une présentation du projet de #numérisation des #collections naturalistes françaises
- les équipements disponibles
- les partenaires impliqués

Et nouveauté : une page dédiée à toutes nos actualités !

JOURNEE 3D Produire, analyser, gérer et diffuser les données 3D dans les sciences naturelles : de la conservation des collection naturalistes aux beso - YouTube Auditorium de la Grande Galerie de l'Evolution, Muséum national d'Histoire naturelle – les 29 et 30/01/2025

Le @mnhn.fr a organisé les #Journées3D.
2 jours pour discuter des données issues de la numérisation 3D des spécimens naturalistes :
- pour la #recherche
- pour les #collections naturalistes
- pour la gestion de ces données

Retrouver l'intégralité des présentations ici :

youtube.com/playlist?lis...

Top: black and white 3D rendering of a dusky basslet fish Bottom left: purple/pink 3D rendering of the brain of the fish, with a scale bar representing 0.5 mm Bottom right: A photograph of a 3D printed and painted anatomical model of the fish brain on a white stand, with colors demonstrating anatomical regions.

Top: black and white 3D rendering of a midwife toad Bottom left: purple/pink 3D rendering of the brain of the frog, with a scale bar representing 1 mm Bottom right: A photograph of a 3D printed and painted anatomical model of the frog brain on a white stand, with colors demonstrating anatomical regions.

Top: black and white 3D rendering of a plated lizard Bottom left: purple/pink 3D rendering of the brain of the lizard, with a scale bar representing 3 mm Bottom right: A photograph of a 3D printed and painted anatomical model of the lizard brain on a white stand, with colors demonstrating anatomical regions.

I used my 3D printer to create educational anatomical models of the brains of fish, frog, & lizard 🐟🐸🦎 The (color-blind friendly) colors demonstrate anatomical regions, and the 🧠 are many times larger than their real size. They can be removed from their stands for closer examination/comparison 🧪

Camille presenting the poster entitled: From Specimens to Digital Twin: High-Throughput Pipeline for Synchrotron Imaging of Museum Collections

Congrats to Camille Berruyer and the NOVITOM team, who presented their poster at #Technart:
4000 arthropod specimens from @mnhn.fr are being digitized using synchrotron microCT at @esrf.fr , with a high-throughput pipeline developed for #e-COL+.
#OpenScience
#3DImaging

3 photos of fish scanned in 3D and key figures for the ScanAllTypes project: - 362 types scanned - including 130 holotypes - spread across 11 orders and 86 families of fish

ScanAllTypes: 362 fish types digitized in 3D, thanks to the operators (👋 @m0neverest.bsky.social , @morganproust.bsky.social et K. Leblanc) and to the ichthyology collection team.

A unique expertise in X-ray tomography, to preserve and share the @mnhn.fr's heritage.
#OpenScience

3 photos de poissons numérisés en 3D et chiffres clés du projet ScanAllTypes : - 362 types scannés - dont 130 holotypes - répartis sur 11 ordres et 86 familles de poissons

362 types de poissons numérisés en 3D grâce aux opérateurs (👋 @m0neverest.bsky.social, @morganproust.bsky.social et K. Leblanc) et aux équipes des collections d'ichtyologie.

Un savoir-faire unique en tomo à rayons X, développé pour préserver et partager le patrimoine du @mnhn.fr. #ScienceOuverte

La deadline approche (30 avril)
N'hésitez pas à envoyer votre candidature si vous voulez participer au projet e-COL+ en tant qu'operateur.ice de numérisation

L'occasion de découvrir que les numérisations 3D sont diffusées sous licence libre. Déjà 14000 fichiers proposés ! #ScienceOuverte

Technicien de collection spécialisé en numérisation 3D (F/H) @ Muséum national d'Histoire naturelle Muséum national d'Histoire naturellerecrute !

#JobAlert!
Nous cherchons un opérateur de numérisation pour le projet e-COL+.
Si vous avez de l'expérience avec la numérisation 3D (acquisition ou post-traitement) et avec les collections naturalistes, n'hésitez pas à postuler : recrutement.mnhn.fr/front-jobs-d...

🗓️ Deadline : 30 avril 2025